Když se odněkud z jiné dimenze objeví ohromná věž a osoba, která si říká "The End", následuje zkáza a hrozba, že za pouhých 13 dní bude svět zničen. Na záchranu je vytvořen tým SEALED, jehož členové ovládají nadpřirozené schopnosti.
Členové SEALED se musí pokusit proniknout až na vrchol věže a zabít "The End", ale než se k němu dostanou, budou muset podstoupit oběť - čím výše se dostanou, tím méně jich zůstane. Hrozí také, že někteří členové SEALED by mohli zradit a přidat se v závěrečném boji na stranu "The End".

Lost Dimension je tahové RPG, ve kterém hráči postupují přes jednotlivá patra věže plné nepřátel. Aby hráči mohli postoupit výše, musí patro vyčistit od nepřátel, ale také vyřadit někoho ze svého středu. Tahový soubojový systém je založen na volném pohybu (v oblasti vymezené rychlostí postavy) a využívání běžných zbraní a speciálních dovedností. Zajímavostí je přítomnost zrádce/zrádců, které při každé hře reprezentují jiné postavy. Hráč se tak snaží zrádce odhalit a ovlivňováním vztahů ve skupině docílit vyřazení postavy zrádce. Pokud se mu to nepodaří, zrádce bude v závěrečném souboji bojovat proti němu.